Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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COPS7AQ9UBW8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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COPS7AQ9UBW8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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