Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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