Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms