Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 AQP4-AS1-206ENST00000628174 919 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 BRCC3-210ENST00000630295 954 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP9-9Q9BYP9 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079880.1-201ENST00000603040 2046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA22-204ENST00000541913 1683 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNTL5-201ENST00000392800 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SCRN3-202ENST00000409673 1788 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM19-204ENST00000549735 1772 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PLS3-AS1-202ENST00000607680 1763 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AP4S1-201ENST00000216366 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SSX6-202ENST00000412590 1461 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA8P1-202ENST00000336399 1524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RBP2-201ENST00000232217 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPM8-202ENST00000355722 904 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SUN5-201ENST00000356173 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00970-201ENST00000366408 1129 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 C4BPB-202ENST00000367076 1113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 COPS5P1-201ENST00000415778 785 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 GRTP1-AS1-202ENST00000423246 465 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359555.1-201ENST00000437016 806 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-9Q9BYP9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms