Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms