Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VN1R3Q9BXE9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms