Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCMBPQ9BTE3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms