Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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