Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP88Q99567 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms