Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms