Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms