Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms