Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E3Q969T4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms