Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms