Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9XQ93008 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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