Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG3Q8WXD2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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