Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEMA6DQ8NFY4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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