Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms