Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SNX20Q7Z614 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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