Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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