Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD54Q6NXT1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms