Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD40Q6AI12 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms