Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX8Q68G74 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 AC016737.1-201ENST00000605739 1068 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LHX8Q68G74 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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