Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms