Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCAF6Q58WW2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCAF6Q58WW2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms