Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms