Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LETM2Q2VYF4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LETM2Q2VYF4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms