Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTF1Q16619 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms