Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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EFNB3Q15768 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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EFNB3Q15768 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EFNB3Q15768 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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EFNB3Q15768 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
EFNB3Q15768 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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