Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALX1Q15699 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALX1Q15699 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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