Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms