Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDK5R1Q15078 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms