Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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HERC3Q15034 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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HERC3Q15034 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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HERC3Q15034 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HERC3Q15034 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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HERC3Q15034 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HERC3Q15034 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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HERC3Q15034 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC3Q15034 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HERC3Q15034 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HERC3Q15034 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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HERC3Q15034 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC3Q15034 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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