Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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CHD4Q14839 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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