Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT33BQ14525 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT33BQ14525 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT33BQ14525 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms