Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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GTF2H3Q13889 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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GTF2H3Q13889 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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GTF2H3Q13889 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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