Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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