Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALCAMQ13740 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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