Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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