Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BFSP2Q13515 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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