Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC02525-202ENST00000435043 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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