Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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