Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK3Q13003 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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