Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RAB40BQ12829 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RAB40BQ12829 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RAB40BQ12829 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB40BQ12829 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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