Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms