Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDE4DQ08499 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms