Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms