Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms