Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms