Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBE1Q04446 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.4 ms